多形红斑型Stevens-Johnson综合征的临床表现独特且多样。患者通常会出现局部病变，其特点是病变直径小于3cm，累及的皮肤区域不超过体表面积的20%。这些病变常常突然出现在手脚背侧、前臂、腿以及脚掌足底等区域。在疾病早期，患者可能出现环形红斑和丘疹，随着病情的发展，可能演变为水疱或囊泡。某些损伤甚至可能融合成大面积的水疱。除了皮肤症状，患者还可能出现全身性症状，如发热、咽痛、不适、关节痛和呕吐等。病变还可能影响口咽部黏膜、结膜、生殖器黏膜等。整个病程通常不超过4周。
毒性表皮坏死溶解型Stevens-Johnson综合征则更为严重。前驱症状包括不适、发热以及皮肤和结膜的烧灼感。皮疹通常表现为麻疹样，并可能迅速扩散至面部和肢体。随着病情的恶化，病变可能相互融合，形成大水泡并导致皮肤剥离。这一类型的特征在于其影响的皮肤面积超过20%，并且伴有多种并发症，如口腔粘膜、唇粘膜、生殖器粘膜和结膜的损伤，以及发热、白细胞增多、肾衰竭等一系列严重症状。
在Stevens-Johnson综合征中，眼部表现也是重要的症状之一。非特异性结膜炎是常见的眼部表现，可在皮肤受累前发生。大约15％至75％的患者可能出现双侧卡他性、化脓性和假膜性结膜炎。还可能发生严重的前葡萄膜炎和角膜溃疡。这些眼部症状通常在综合征急性期出现，并可能持续2至4周。需要注意的是，Stevens-Johnson单眼病例相对较少涉及。
进入慢性期后，由于持续的炎症反应，可能会形成结膜疤痕。当球结膜与眼睑结膜粘连时，可能会出现眼眶囊肿。结膜杯状细胞的损伤可能导致泪道疤痕化，进而影响泪膜的正常功能。即使没有出现泪道疤痕化，患者也可能会出现畏光症状。这些患者的泪膜异常通常是由粘液层缺乏和角膜干燥引起的。还有一些患者可能会出现与倒睫、眼睑内翻、角结膜炎睑缘炎无关的继发性结膜炎，这种症状可能会持续8天至5周。